loading...

بلاگی برای یو فایل

بازدید : 73

 

دریافت فایل

 فایل جزوه بخش دوم آموزش نرم افزار طراحی پرایمر Primer 3

قابل توجه کاربران و دانشجویان عزیز و گرامی: فایلی که هم اکنون معرف حضور شماست جامع ترین و کامل ترین فایل pdf  جزوه بخش دوم آموزش نرم افزار طراحی پرایمر Primer 3 می باشد. این فایل شامل 6 صفحه می باشد. و در غالب فرمتpdf تهیه شده و هم اکنون آماده دانلود است. امیدواریم که سودمند بوده و مورد استفاده شما سروران گرامی واقع گردد. در صورت تمایل و نیاز می توانید این فایل ارزشمند و مفید را از فروشگاه سایت یوفایل با مناسب ترین قیمت خریداری و دانلود نمایید.

بخش دوم: آموزش نرم افزار طراحی پرایمر Primer 3

پرایمر یکی از مهمترین عوامل در موفقیت یا شکست در PCR محسوب میشود. در طراحی پرایمر، اصول زیر را باید همیشه مدنظر قرار دهیم:
۸۱ جفت باز باشد، پرایمر با طول کوچک، اتصال غیر اختصاصی را افزایش - – طول متوسط هر پرایمر بین ۰۳ داده و پرایمر بزرگ، سرعت هیبریداسیون را کم میکند.

– درصد GC ۰۳ درصد - پرایمرهای مستقیم و معکوس نزدیک هم باشد که در حالت ایدهآل، حدود ۰۳میباشد.
– پرایمرهای مسطتق یم و معکوس نباید مکمل همدیگر باشطند، ز یرا باعث تولید پرایمر دایمر میشود که به ویژه در real-time PCR مشکل ایجاد میکند.
– در انتهای ۰ پرایم پرایمر بطا ید حداقل یک پورین ) G یا C ( قرار گیرد ولی در عین حال باید دقت کرد که انتهای ۰ پرایم غنی از پورین نباشد.
– باید تا حد امکان از توالیهای پالیندرومیک )برای مثال GTTAAC ( در ۰ پرایم پرایمر جلوگیری کرد، زیرا احتمال تشکیل پرایمر دایمر را افزایش میدهند.
– در حد امکان، تعداد پورینها با پریمیدینها برابر باشد.
– از توالیهای تکراری )برای مثال AAAAAA ( در پرایمر، به ویژه در ۰ پرایم جلوگیری شود.
– دمای Tm دو پرایمر نزدیک هم باشد.

نرم افزاره ها ی متعدد ی برای طراحی پرایمر وجود دارد که بر ای نمونه می توان به Gene Runner و OLIGO Primer Analysis اشاره کرد.

مهرگان یکشنبه 21 مهر 1398 زمان : 10:30 نظرات (0)
بازدید : 37

 

 دریافت فایل

جامع ترین فایل پاورپوینت اصول طراحی پرایمر 28 اسلاید

قابل توجه کاربران و دانشجویان عزیز و گرامی: فایلی که هم اکنون معرف حضور شماست جامع ترین و کامل ترین فایل پاورپوینت با موضوع اصول طراحی پرایمر می باشد. این فایل شامل 28 اسلاید زیبا  سودمند و قابل ویرایش  می باشد. و در غالب فرمت ppt تهیه شده و هم اکنون آماده دانلود است. امیدواریم که سودمند بوده و مورد استفاده شما سروران گرامی واقع گردد. در صورت تمایل و نیاز می توانید این فایل ارزشمند و مفید را از فروشگاه سایت یوفایل خریداری و دانلود نمایید.

پاورپوینت اصول طراحی پرایمر

قسمتهایی از متن فایل:

دوازده نکته مهم در طراحی پرایمر

  • .1طول یک پرایمر وطول نهایی قطعه
  • .2تعیین دمای ذوب
  • .3میزان G+C
  • .4دمای اتصال آغازگر (Ta)
  • .5دمای اتصال آغازگر بهتر است بین 55-65 درجه سانتیگراد باشد.
  • .6حضور باز G  و C برای افزایش میزان عملکرد
  • .7ساختمان ثانویه(ساختمان سنجاق سری،دایمر داخلی،کراس دیمر)
  • .8اجتناب از تکرار پذیری نوکلئوتیدهای دوتایی
  • .9استحکام در ناحیه 3′
  • .10اجتناب از طراحی آغازگرهای همولوگ (استفاده از BLAST)
  • .11نزدیک بودن دمای اتصال دوپرایمر راست و چپ و نیز انتخاب دمای اتصال مناسب
  • .12در صورت امکان انتهای 3′ آغازگر از کدون رمز کننده ی  متیونین و تریپتوفان استفاده گردد.

بعضی شرکت های بین المللی تولید کننده پرایمر

شرکت های زیادی وجود دارند که خدمات ساخت و خالص سازی پرایمرها را طی چند روز انجام می دهند.

Sigma, Genset, Biosource, Mid Land, Integrated DNA technologies, P E Biosystems, MWG Biotech, Genosys , …

بعضی شرکت های زیست فناور ایرانی تولید کننده پرایمر

  • تکاپوزیست
  • کوثر
  • پیشگام
  • بنیان ژن
  • فرمون پارسایان
  • ........
مهرگان یکشنبه 07 مهر 1398 زمان : 13:55 نظرات (0)
بازدید : 121

 

دریافت فایل

 جامع ترین فایل پاورپوینت آموزش نرم افزارOLigo7 طراحی پرایمر به زبان انگلیسی

دانشجویان و کاربران گرامی فایل حاضر کامل ترین و جامع ترین فایل پاورپوینت آموزش نرم افزارOLigo 7 طراحی پرایمر به زبان انگلیسی ویژه رشته های بیو تکنولوژی کشاورزی و پزشکی می باشد. این فایل  در غالب فرمت ppt تهیه شده است که هم اکنون آماده دانلود می باشد.در صورت تمایل می توانید این فایل ارزشمند را از فروشگاه سایت خریداری و دانلود نمایید.

آموزش طراحی پرایمر قسمت دوم: آموزش قدم به قدم نرم افزار الیگو 7 (oligo 7)

Oligo7 نرم افزار قوی و کاربردی برای انجام آنالیزهایی بر روی ژن ها و طراحی پرایمر برای انجام واکنش PCR است.

ویژگی های اصلی نرم افزار Oligo:
- طراحی پرایمر ها به صورت خودکار
- امکان طراحی پرایمر به صورت دستی
- بررسی تشکیل ساختارهای ثانویه و سنجاق سری در پرایمر ها
- تجزیه و تحلیل پرایمرهای پی سی آر
- طراحی و تجزیه و تحلیل انواع پروب ها
- نمایش ترکیب های مفید هر پرایمر

چکيده محتواي فابل:

Rules for PCR Primer Selection

and Presentation of the Software

Contents

•1. PCR Primer Selection Criteria
- -.......
•2. Oligo 7 Analyze Features
- -.......
•3. Search Options
- ......
•4. Oligonucleotide Database
- multiplexing
•5. Concluding Remarks
 

Primer Stability Calculations

An introduction to the nearest neighbor method

One of the most important characteristics of a primer is its the melting temperature and stability of various its regions. The most accurate Tm calculation provides the nearest neighbor method. The primer Tm formula is quite complex:

 Tm (°C) = DH/(DS + R * ln[C]) + 16.6 log [K+]/(1+0.7*[K+]) – 273.15

مهرگان شنبه 29 تیر 1398 زمان : 11:37 نظرات (0)
اطلاعات کاربری
آمار سایت
  • کل مطالب : 9081
  • کل نظرات : 0
  • افراد آنلاین : 19
  • تعداد اعضا : 0
  • آی پی امروز : 420
  • آی پی دیروز : 1091
  • بازدید امروز : 12,120
  • باردید دیروز : 7,104
  • گوگل امروز : 138
  • گوگل دیروز : 217
  • بازدید هفته : 50,574
  • بازدید ماه : 85,121
  • بازدید سال : 402,681
  • بازدید کلی : 2,212,955

  • نام کاربری :
    رمز عبور :
    تکرار رمز :
    موبایل :
    ایمیل :
    نام اصلی :
    کد امنیتی :
     
    کد امنیتی
     
    بارگزاری مجدد