فایل جزوه بخش دوم آموزش نرم افزار طراحی پرایمر Primer 3
قابل توجه کاربران و دانشجویان عزیز و گرامی: فایلی که هم اکنون معرف حضور شماست جامع ترین و کامل ترین فایل pdf جزوه بخش دوم آموزش نرم افزار طراحی پرایمر Primer 3 می باشد. این فایل شامل 6 صفحه می باشد. و در غالب فرمتpdf تهیه شده و هم اکنون آماده دانلود است. امیدواریم که سودمند بوده و مورد استفاده شما سروران گرامی واقع گردد. در صورت تمایل و نیاز می توانید این فایل ارزشمند و مفید را از فروشگاه سایت یوفایل با مناسب ترین قیمت خریداری و دانلود نمایید.
بخش دوم: آموزش نرم افزار طراحی پرایمر Primer 3
پرایمر یکی از مهمترین عوامل در موفقیت یا شکست در PCR محسوب میشود. در طراحی پرایمر، اصول زیر را باید همیشه مدنظر قرار دهیم:
۸۱ جفت باز باشد، پرایمر با طول کوچک، اتصال غیر اختصاصی را افزایش - – طول متوسط هر پرایمر بین ۰۳ داده و پرایمر بزرگ، سرعت هیبریداسیون را کم میکند.
– درصد GC ۰۳ درصد - پرایمرهای مستقیم و معکوس نزدیک هم باشد که در حالت ایدهآل، حدود ۰۳میباشد.
– پرایمرهای مسطتق یم و معکوس نباید مکمل همدیگر باشطند، ز یرا باعث تولید پرایمر دایمر میشود که به ویژه در real-time PCR مشکل ایجاد میکند.
– در انتهای ۰ پرایم پرایمر بطا ید حداقل یک پورین ) G یا C ( قرار گیرد ولی در عین حال باید دقت کرد که انتهای ۰ پرایم غنی از پورین نباشد.
– باید تا حد امکان از توالیهای پالیندرومیک )برای مثال GTTAAC ( در ۰ پرایم پرایمر جلوگیری کرد، زیرا احتمال تشکیل پرایمر دایمر را افزایش میدهند.
– در حد امکان، تعداد پورینها با پریمیدینها برابر باشد.
– از توالیهای تکراری )برای مثال AAAAAA ( در پرایمر، به ویژه در ۰ پرایم جلوگیری شود.
– دمای Tm دو پرایمر نزدیک هم باشد.
نرم افزاره ها ی متعدد ی برای طراحی پرایمر وجود دارد که بر ای نمونه می توان به Gene Runner و OLIGO Primer Analysis اشاره کرد.